MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK (YL) (TEZLİ)
Yüksek Lisans	TYYÇ: 7. Düzey	QF-EHEA: 2. Düzey	EQF-LLL: 7. Düzey

Ders Genel Tanıtım Bilgileri

Ders Kodu:

3015002007

Ders İsmi:

İşlevsel Genomik

Ders Yarıyılı:

Bahar

Ders Kredileri:

Teorik	Pratik	Kredi	AKTS
3	0	3	6

Öğretim Dili:

Ders Koşulu:

Ders İş Deneyimini Gerektiriyor mu?:

Hayır

Dersin Türü:

Anabilim Dalı/Lisansüstü Seçmeli

Dersin Seviyesi:

Yüksek Lisans

TYYÇ:7. Düzey

QF-EHEA:2. Düzey

EQF-LLL:7. Düzey

Dersin Veriliş Şekli:

Yüz yüze

Dersin Koordinatörü:

Prof. Dr. Meliha Burcu IRMAK YAZICIOĞLU

Dersi Veren(ler):

Dersin Yardımcıları:

Dersin Amaç ve İçeriği

Dersin Amacı:

Dersin amacı öğrencilere İşlevsel Genomik Araştırmalardaki güncel konularla tanışmalarını sağlamaktır. Çeşitli araştırma yöntemlerini ve uygulamalarının gösterilmesi de hedeflenmektedir./

Dersin İçeriği:

Fonksiyonel Genomiğin Tanımı, Kullanılan Yöntemler, Gen anlatımındaki Değişimlerin Gen Düzeyinde Belirlenmesi, Total RNA ve mRNA izolasyonları, Çıkarımlı cDNA Kütüphanelerinin Kurulması ve taranması, Gen Anlatımındaki değişimlerin Farklı Gösterim Tekniği ile analizi, Baskılayıcı Çıkarım Hibridizasyon Yöntemi, Mikroarray Kullanılarak Gen Anlatım analizi, Gen Ekspresyonunun Seri Analizi (SADE), Gen anlatımındaki Değişimlerin Protein Düzeyinde Belirlenmesi Proteomik Yöntemler, İki Boyutlu Jel Elektroforeziyle Protein analizi, Protein karakterizasyon yöntemleri, Gen Anlatım Analizinde Kullanılan Biyoinformatik Yöntemler, Nükleik Asit ve Protein Analizleri İçin İnternet Kaynakları, Nükleik Asit ve Protein Benzerlik Analizleri, Protein Yapı Modellemesi

Öğrenme Kazanımları

Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;

Öğrenme Kazanımları

1 - Bilgi
Kuramsal - Olgusal
1) Bu dersin sonunda öğrenciler gen ve protein anlatım analizleri için mevcut olan güncel işlevsel genomik yöntemleri öğrenirler.
2 - Beceriler
Bilişsel - Uygulamalı
3 - Yetkinlikler
İletişim ve Sosyal Yetkinlik
Öğrenme Yetkinliği
Alana Özgü Yetkinlik
1) Öğrenciler işlevsel genomik çalışmalar sonucu elde edilen verileri değerlendirmeyi öğrenir.
2) Öğrenciler bu yaklaşımların kendi araştırmalarında uygulanabilirliğini değerlendirebilirler.
Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği

Ders Akış Planı

Hafta	Konu	Ön Hazırlık
1)	Fonksiyonel Genomiğe Giriş ve Fonksiyonel Genomik Araştırmalarda Kullanılan Temel Yöntemler	Ders kitabı ve Ders notları
2)	Total RNA ve mRNA izolasyonları ve Analizi	Ders kitabı ve Ders notları
3)	Gen Kütüphanelerinin Oluşturulması ve İşlevsel GenomikAraştırmalarda Kullanımı	Ders kitabı ve Ders notları
4)	Çıkarımlı cDNA Kütüphanelerinin Kurulması ve Taranması	Ders kitabı ve Ders notları
5)	Gen Anlatımındaki değişimlerin Farklı Gösterim Tekniği ile Analizi	Ders kitabı ve Ders notları
6)	Baskılayıcı Çıkarım Hibridizasyon Yöntemi	Ders kitabı ve Ders notları
7)	Gen Ekspresyonunun Seri Analizi (SADE)	Ders kitabı ve Ders notları
8)	Ara Sınav
9)	Mikroarray Kullanılarak Gen Anlatım analizi	Ders kitabı ve Ders notları
10)	Mikroarray Veri Analiz Yöntemleri	Ders kitabı ve Ders notları
11)	Proteomikte Kullanılan Protein analiz Yöntemleri	Ders kitabı ve Ders notları
12)	İki Boyutlu Jel Elektroforezi	Ders kitabı ve Ders notları
13)	Kütle Spektrometresiyle Protein Karakterizasyonu	Ders kitabı ve Ders notları
14)	Biyoinformatik: DNA ve Protein Benzerlik Analizleri	Ders kitabı ve Ders notları
15)	Final

Kaynaklar

Ders Notları / Kitaplar:	Functional Genomics- Practical Approach Stephen P. Hunt and Frederick J. Livesey Oxford University Press 2000 Principles of Gene Manipulation Sandy B., Primrose, Richard M. Twyman, Madlen, MA; Oxford: Blackwell Pub., 2006
Diğer Kaynaklar:	Functional Genomics- Practical Approach Stephen P. Hunt and Frederick J. Livesey Oxford University Press 2000 Principles of Gene Manipulation Sandy B., Primrose, Richard M. Twyman, Madlen, MA; Oxford: Blackwell Pub., 2006

Ders - Program Öğrenme Kazanım İlişkisi

Ders Öğrenme Kazanımları	1	2	3
Program Kazanımları
1) Alanındaki güncel bilgileri içeren ders kitapları, uygulama araç-gereçleri ve diğer kaynaklarla desteklenen ileri düzeydeki kuramsal ve uygulamalı bilgilere sahip olma.
2) Alanında edindiği ileri düzeydeki kuramsal ve uygulamalı bilgileri kullanabilme.
3) Alanında edindiği ileri düzeydeki bilgi ve becerileri kullanarak verileri yorumlayabilme ve değerlendirebilme, sorunları tanımlayabilme, analiz edebilme, araştırmalara ve kanıtlara dayalı çözüm önerileri geliştirebilme.
4) Alanı ile ilgili konularda ilgili kişi ve kurumları bilgilendirebilme; düşüncelerini ve sorunlara ilişkin çözüm önerilerini yazılı ve sözlü olarak aktarabilme.
5) Alanı ile ilgili konularda düşüncelerini ve sorunlara ilişkin çözüm önerilerini nicel ve nitel verilerle destekleyerek uzman olan ve olmayan kişilerle paylaşabilme.
6) Toplumsal sorumluluk bilinci ile yaşadığı sosyal çevre için proje ve etkinlikler düzenleyebilme ve bunları uygulayabilme.
7) Bir yabancı dili en az Avrupa Dil Portföyü B1 Genel Düzeyi'nde kullanarak alanındaki bilgileri izleyebilme ve meslektaşları ile iletişim kurabilme.
8) Alanının gerektirdiği en az Avrupa Bilgisayar Kullanma Lisansı İleri Düzeyinde bilgisayar yazılımı ile birlikte bilişim ve iletişim teknolojilerini kullanabilme.
9) Alanında edindiği ileri düzeydeki bilgi ve becerileri eleştirel bir yaklaşımla değerlendirebilme,
10) Öğrenme gereksinimlerini belirleyebilme ve öğrenmesini yönlendirebilme.
11) Yaşamboyu öğrenmeye ilişkin olumlu tutum geliştirebilme.
12) Alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, uygulanması ve sonuçlarının duyurulması aşamalarında toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerlere uygun hareket etme.
13) Sosyal hakların evrenselliği, sosyal adalet, kalite kültürü ve kültürel değerlerin korunması ile çevre koruma, iş sağlığı ve güvenliği konularında yeterli bilince sahip olma.
14) Alanı ile ilgili ileri düzeydeki bir çalışmayı bağımsız olarak yürütebilme.
15) Alanı ile ilgili uygulamalarda karşılaşılan ve öngörülemeyen karmaşık sorunları çözmek için bireysel ve ekip üyesi olarak sorumluluk alabilme.
16) Sorumluluğu altında çalışanların bir proje çerçevesinde gelişimlerine yönelik etkinlikleri planlayabilme ve yönetebilme.

Ders - Öğrenme Kazanımı İlişkisi

Etkisi Yok	1 En Düşük	2 Düşük	3 Orta	4 Yüksek	5 En Yüksek

	Dersin Program Kazanımlarına Etkisi	Katkı Payı
1)	Alanındaki güncel bilgileri içeren ders kitapları, uygulama araç-gereçleri ve diğer kaynaklarla desteklenen ileri düzeydeki kuramsal ve uygulamalı bilgilere sahip olma.
2)	Alanında edindiği ileri düzeydeki kuramsal ve uygulamalı bilgileri kullanabilme.
3)	Alanında edindiği ileri düzeydeki bilgi ve becerileri kullanarak verileri yorumlayabilme ve değerlendirebilme, sorunları tanımlayabilme, analiz edebilme, araştırmalara ve kanıtlara dayalı çözüm önerileri geliştirebilme.
4)	Alanı ile ilgili konularda ilgili kişi ve kurumları bilgilendirebilme; düşüncelerini ve sorunlara ilişkin çözüm önerilerini yazılı ve sözlü olarak aktarabilme.
5)	Alanı ile ilgili konularda düşüncelerini ve sorunlara ilişkin çözüm önerilerini nicel ve nitel verilerle destekleyerek uzman olan ve olmayan kişilerle paylaşabilme.
6)	Toplumsal sorumluluk bilinci ile yaşadığı sosyal çevre için proje ve etkinlikler düzenleyebilme ve bunları uygulayabilme.
7)	Bir yabancı dili en az Avrupa Dil Portföyü B1 Genel Düzeyi'nde kullanarak alanındaki bilgileri izleyebilme ve meslektaşları ile iletişim kurabilme.
8)	Alanının gerektirdiği en az Avrupa Bilgisayar Kullanma Lisansı İleri Düzeyinde bilgisayar yazılımı ile birlikte bilişim ve iletişim teknolojilerini kullanabilme.
9)	Alanında edindiği ileri düzeydeki bilgi ve becerileri eleştirel bir yaklaşımla değerlendirebilme,
10)	Öğrenme gereksinimlerini belirleyebilme ve öğrenmesini yönlendirebilme.
11)	Yaşamboyu öğrenmeye ilişkin olumlu tutum geliştirebilme.
12)	Alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, uygulanması ve sonuçlarının duyurulması aşamalarında toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerlere uygun hareket etme.
13)	Sosyal hakların evrenselliği, sosyal adalet, kalite kültürü ve kültürel değerlerin korunması ile çevre koruma, iş sağlığı ve güvenliği konularında yeterli bilince sahip olma.
14)	Alanı ile ilgili ileri düzeydeki bir çalışmayı bağımsız olarak yürütebilme.
15)	Alanı ile ilgili uygulamalarda karşılaşılan ve öngörülemeyen karmaşık sorunları çözmek için bireysel ve ekip üyesi olarak sorumluluk alabilme.
16)	Sorumluluğu altında çalışanların bir proje çerçevesinde gelişimlerine yönelik etkinlikleri planlayabilme ve yönetebilme.

Öğrenme Etkinliği ve Öğretme Yöntemleri

Alan Çalışması
Anlatım
Ders
Ödev
Rapor Yazma

Ölçme ve Değerlendirme Yöntemleri ve Kriterleri

Yazılı Sınav (Açık uçlu sorular, çoktan seçmeli, doğru yanlış, eşleştirme, boşluk doldurma, sıralama)
Ödev
Sunum

Ölçme ve Değerlendirme

Yarıyıl İçi Çalışmaları	Aktivite Sayısı	Katkı Payı
Sunum	2	% 10
Ara Sınavlar	1	% 30
Yarıyıl/Yıl Sonu Sınavı	1	% 60
Toplam		% 100
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTU KATKISI		% 40
YARIYIL SONU ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTUNA KATKISI		% 60
Toplam		% 100

İş Yükü ve AKTS Kredisi Hesaplaması

Aktiviteler	Aktivite Sayısı	Süre (Saat)	İş Yükü
Ders Saati	15	3	45
Sınıf Dışı Ders Çalışması	15	5	75
Sunum / Seminer	5	3	15
Ödevler	10	4	40
Ara Sınavlar	1	3	3
Final	1	3	3
Toplam İş Yükü			181